多哈亚运会上，名不见经传的吴崇魁在赛艇男子轻量级单人双桨的比赛中夺得冠军，人们开始留意这个来自江苏的小伙子。2003年2月，吴崇魁进入南京市水上运动学校。尽管这是他平生第一次接触赛艇运动，但其训练成绩的迅猛提高却让很多“前辈”自叹不如。2006年8月的世锦赛上，首次参加国际大赛的吴崇魁获得四人单桨冠军。在此之前，他在这个项目上只接受了50多天的突击训练。