怀孕三个月小便出血有可能是泌尿系统感染、饮食不当或者是先兆性流产的原因。需要及时到医院做B超的检查，同时做尿常规、血常规的检查，帮助确定具体的病因，针对性的治疗。

1、泌尿系统感染：如果泌尿系统存在病毒或者细菌感染会引起泌尿系统感染，导致出现隐血的现象。

可以在医生的指导下，通过服用左氧氟沙星消炎药物帮助缓解病情。

2、饮食不当：最近这段时间如果摄入生冷刺激的食物或者上火的食物，也有可能会导致小便有出血的现象。

最好在医生的指导下，通过服用清热解毒的药物帮助缓解病情。在平时多喝一些温开水，多吃些新鲜的蔬菜和水果，在饮食上以温和的食物为主。

3、先兆性流产：在怀孕的前期有可能因为饮食或者做重体力的工作导致先兆性流产，引起小便出血的情况。病情相对比较严重，一定要及时的就医治疗。

最好到医院做B超的检查，查看子宫内胎儿的发育情况，如果出现了先兆流产流产，需要遵医嘱服用保胎药物治疗。

在怀孕的期间身体比较脆弱，要注意休息，不要做剧烈的运动和重体力的工作。